Praktischer Teil - Protein-Microarrays fur die Wirkstoffentwicklung - page 25

(a) (b)

Abbildung 8: Dreidimensionale Darstellung der N-terminalen ATP-Bindetasche des hu-
manen Hsp90α mit Geldanamycin (dunkelgrün, PDB ID 1YET, Geldanamycin blau) und
ATP (hellgrün, PDB ID 3T0Z, ATP rot) als Liganden. Das Alignement wurde mit der Gra-
foksoftware PyMol (DeLano Scienctific LLC) entworfen. Geld hervorgehoben sind die
Aminosäuren, die mit den Liganden Wechselwirkungen eingehen. (a) Vollständige N-ter-
minale Domäne. (b) ATP-Bindetasche vergrößert. Beschriftung der wichtigsten Aminosäu-
ren für die Ligandenbidnung.

für das Nichtbinden von Geldanamycin verantwortlich gemacht. Das humane
Hitzeschockprotein bildet mit Geldanamycin in diesen Positionen Wassestoff-
brückenbindungen aus und stabilisiert den Chinonring von Geldanamycin.
Das Molekül wird in der Bindungstasche gehalten. Dies konnten M ILLSON ET
AL (2011) in Cokristallisationen von Hsp90α mit Geldanamycin nachweisen.
Außerdem vermuteten sie, dass eine Veränderung von Valin zu Methionin in
der Position 150 (V150M) die Bindung von Geldanamycin hemmt. Auch Z APF
ET AL . (2011) zeigten, dass Wassermoleküle für die Bindung von Geldan-
amycin in the ATP-Bindetasche von großer Bedeutung sind. 54, 55, 56 Danach
wurde ein Alignment mit den Proteinsequenzen der NTD von Hsp90α aus
Homo sapiens , HtpG aus S. hygroscopicus und HtpG aus H. pylori durchge-
führt, um die relevanten Aminosäuren für die Bindung von Geldanamycin in
der ATP-Bindetasche vergleichen zu können (Abb. 9). Die relevanten Amino-

54 Zapf, C. et al. (2011)
55 Pallavi, R. et al. (2010)
56 Millson, S. et al. (2011)