Biomedical Engineering Reference
In-Depth Information
Table 4.18
Sigmoid predictor ranking by MSE for gene
Cdh
1(
x
7
) in mutated network (Top 10
predictors shown), correct predictor is
x
5
,
x
6
,
x
9
Rank
1 input
2 inputs
3 inputs
4 inputs
Predictor
MSE
Predictor
MSE
Predictor
MSE
Predictor
MSE
1
x
6
0.1722
x
6
,
x
9
0.0370
x
5
,
x
6
,
x
9
0.0069
x
1
,
x
3
,
x
6
,
x
9
0.0062
2
x
9
0.1823
x
5
,
x
9
0.1009
x
1
,
x
6
,
x
9
0.0346
x
1
,
x
4
,
x
6
,
x
9
0.0065
3
x
8
0.2875
x
2
,
x
6
0.1198
x
2
,
x
6
,
x
9
0.0557
x
5
,
x
6
,
x
8
,
x
9
0.0066
4
x
3
0.3265
x
8
,
x
9
0.1282
x
6
,
x
8
,
x
9
0.0611
x
3
,
x
5
,
x
6
,
x
9
0.0066
5
x
1
0.3492
x
1
,
x
6
0.1310
x
4
,
x
6
,
x
9
0.0677
x
1
,
x
5
,
x
6
,
x
9
0.0067
6
x
2
0.3922
x
5
,
x
6
0.1322
x
3
,
x
6
,
x
9
0.0769
x
2
,
x
5
,
x
6
,
x
9
0.0067
7
x
5
0.3988
x
1
,
x
3
0.1352
x
5
,
x
6
,
x
8
0.0922
x
4
,
x
5
,
x
6
,
x
9
0.0070
8
x
4
0.4357
x
3
,
x
6
0.1417
x
4
,
x
6
,
x
8
0.0954
x
3
,
x
4
,
x
6
,
x
9
0.0318
9
x
4
,
x
9
0.1511
x
1
,
x
5
,
x
6
0.0966
x
1
,
x
6
,
x
8
,
x
9
0.0339
10
x
1
,
x
9
0.1569
x
1
,
x
3
,
x
6
0.0986
x
4
,
x
6
,
x
8
,
x
9
0.0363
Table 4.19
Sigmoid predictor ranking by MSE for gene
UbcH
10(
x
8
) in mutated network (Top 10
predictors shown), correct predictor is
x
5
,
x
6
,
x
7
,
x
9
Rank
1 input
2 inputs
3 inputs
4 inputs
Predictor
MSE
Predictor
MSE
Predictor
MSE
Predictor
MSE
1
x
7
0.1799
x
1
,
x
7
0.1581
x
3
,
x
5
,
x
7
0.1136
x
3
,
x
5
,
x
6
,
x
7
0.1126
2
x
4
0.3708
x
6
,
x
7
0.2414
x
1
,
x
4
,
x
7
0.1214
x
1
,
x
3
,
x
5
,
x
7
0.1129
3
x
1
0.3714
x
4
,
x
7
0.2425
x
1
,
x
5
,
x
7
0.1415
x
3
,
x
5
,
x
7
,
x
9
0.1133
4
x
5
0.4013
x
7
,
x
9
0.2481
x
1
,
x
3
,
x
7
0.1480
x
2
,
x
3
,
x
5
,
x
7
0.1152
5
x
6
0.4340
x
5
,
x
7
0.2707
x
1
,
x
7
,
x
9
0.1511
x
1
,
x
4
,
x
5
,
x
7
0.1204
6
x
9
0.4369
x
3
,
x
7
0.2755
x
1
,
x
6
,
x
7
0.1512
x
1
,
x
4
,
x
7
,
x
9
0.1209
7
x
2
0.4431
x
3
,
x
4
0.2755
x
1
,
x
2
,
x
7
0.1529
x
1
,
x
2
,
x
5
,
x
7
0.1215
8
x
3
0.4668
x
2
,
x
7
0.2757
x
4
,
x
6
,
x
7
0.1696
x
1
,
x
3
,
x
4
,
x
7
0.1220
9
x
1
,
x
5
0.2876
x
2
,
x
6
,
x
7
0.1740
x
1
,
x
4
,
x
6
,
x
7
0.1225
10
x
3
,
x
5
0.2927
x
4
,
x
5
,
x
7
0.1752
x
1
,
x
3
,
x
6
,
x
7
0.1237
Table 4.20
Sigmoid predictor ranking by MSE for gene
CycB
(
x
9
) in mutated network (Top 10
predictors shown), correct predictor is
x
6
,
x
7
Rank
1 input
2 inputs
3 inputs
4 inputs
Predictor
MSE
Predictor
MSE
Predictor
MSE
Predictor
MSE
1
x
6
0.1868
x
6
,
x
7
0.0073
x
6
,
x
7
,
x
8
0.0071
x
3
,
x
4
,
x
6
,
x
7
0.0061
2
x
7
0.1874
x
5
,
x
7
0.1219
x
5
,
x
6
,
x
7
0.0385
x
1
,
x
3
,
x
6
,
x
7
0.0068
3
x
3
0.3262
x
7
,
x
8
0.1259
x
4
,
x
6
,
x
7
0.0617
x
2
,
x
6
,
x
7
,
x
8
0.0069
4
x
8
0.3465
x
3
,
x
7
0.1288
x
3
,
x
6
,
x
7
0.0640
x
5
,
x
6
,
x
7
,
x
8
0.0070
5
x
1
0.4170
x
1
,
x
7
0.1481
x
2
,
x
6
,
x
7
0.0656
x
4
,
x
6
,
x
7
,
x
8
0.0071
6
x
4
0.4173
x
6
,
x
8
0.1562
x
1
,
x
6
,
x
7
0.0671
x
1
,
x
6
,
x
7
,
x
8
0.0071
7
x
2
0.4183
x
3
,
x
6
0.1607
x
2
,
x
4
,
x
7
0.0853
x
3
,
x
6
,
x
7
,
x
8
0.0072
8
x
5
0.4214
x
2
,
x
7
0.1624
x
2
,
x
3
,
x
7
0.0884
x
3
,
x
5
,
x
6
,
x
7
0.0074
9
x
5
,
x
6
0.1747
x
3
,
x
7
,
x
8
0.0911
x
1
,
x
5
,
x
6
,
x
7
0.0074
10
x
4
,
x
6
0.1851
x
3
,
x
4
,
x
6
0.0984
x
4
,
x
5
,
x
6
,
x
7
0.0074