Biomedical Engineering Reference
In-Depth Information
Table 4.12
Linear predictor ranking by MSE for gene
CycB
(
x
9
) in mutated network (Top 10
predictors shown), correct predictor is
x
6
,
x
7
Rank
1 input
2 inputs
3 inputs
4 inputs
Predictor
MSE
Predictor
MSE
Predictor
MSE
Predictor
MSE
1
x
7
0.1238
x
6
,
x
7
0.0241
x
6
,
x
7
,
x
8
0.0202
x
3
,
x
6
,
x
7
,
x
8
0.0176
2
x
6
0.1502
x
5
,
x
7
0.0813
x
5
,
x
6
,
x
7
0.0401
x
4
,
x
6
,
x
7
,
x
8
0.0182
3
x
3
0.2220
x
1
,
x
7
0.0957
x
1
,
x
6
,
x
7
0.0429
x
1
,
x
6
,
x
7
,
x
8
0.0189
4
x
8
0.2506
x
7
,
x
8
0.0995
x
4
,
x
6
,
x
7
0.0494
x
5
,
x
6
,
x
7
,
x
8
0.0204
5
x
4
0.2652
x
3
,
x
7
0.1002
x
3
,
x
6
,
x
7
0.0520
x
4
,
x
5
,
x
6
,
x
7
0.0206
6
x
5
0.2716
x
4
,
x
7
0.1064
x
2
,
x
6
,
x
7
0.0531
x
3
,
x
5
,
x
6
,
x
7
0.0207
7
x
2
0.2792
x
3
,
x
6
0.1096
x
2
,
x
3
,
x
7
0.0605
x
2
,
x
6
,
x
7
,
x
8
0.0207
8
x
1
0.2884
x
6
,
x
8
0.1165
x
3
,
x
4
,
x
6
0.0634
x
3
,
x
4
,
x
6
,
x
7
0.0208
9
x
4
,
x
6
0.1211
x
1
,
x
7
,
x
8
0.0657
x
1
,
x
5
,
x
6
,
x
7
0.0208
10
x
2
,
x
7
0.1264
x
5
,
x
7
,
x
8
0.0660
x
1
,
x
3
,
x
6
,
x
7
0.0216
Table 4.13
Sigmoid predictor ranking by MSE for gene
Rb
(
x
2
) in mutated network (Top 10
predictors shown), correct predictor is
x
1
,
x
4
,
x
5
,
x
9
Rank
1 input
2 inputs
3 inputs
4 inputs
Predictor
MSE
Predictor
MSE
Predictor
MSE
Predictor
MSE
1
x
1
0.2722
x
1
,
x
4
0.1244
x
1
,
x
4
,
x
9
0.0404
x
1
,
x
4
,
x
7
,
x
9
0.04035
2
x
8
0.2815
x
5
,
x
8
0.1475
x
1
,
x
3
,
x
4
0.0646
x
1
,
x
4
,
x
8
,
x
9
0.04050
3
x
7
0.3732
x
1
,
x
3
0.1503
x
1
,
x
4
,
x
5
0.0673
x
1
,
x
4
,
x
5
,
x
9
0.04076
4
x
6
0.3899
x
1
,
x
5
0.1534
x
1
,
x
3
,
x
6
0.0745
x
1
,
x
4
,
x
6
,
x
9
0.04073
5
x
3
0.3901
x
5
,
x
6
0.1571
x
1
,
x
3
,
x
5
0.0922
x
1
,
x
3
,
x
4
,
x
5
0.05836
6
x
5
0.3923
x
1
,
x
6
0.1583
x
1
,
x
5
,
x
9
0.0926
x
1
,
x
3
,
x
4
,
x
8
0.06408
7
x
9
0.4013
x
8
,
x
9
0.1623
x
1
,
x
6
,
x
9
0.0951
x
1
,
x
3
,
x
4
,
x
9
0.06436
8
x
4
0.4068
x
7
,
x
8
0.1656
x
1
,
x
4
,
x
8
0.0951
x
1
,
x
3
,
x
4
,
x
7
0.06441
9
x
1
,
x
8
0.1689
x
3
,
x
4
,
x
9
0.0954
x
1
,
x
3
,
x
4
,
x
6
0.06525
10
x
3
,
x
6
0.1774
x
1
,
x
4
,
x
6
0.0982
x
1
,
x
4
,
x
5
,
x
7
0.06658
Table 4.14
Sigmoid predictor ranking by MSE for gene
E
2
F
(
x
3
) in mutated network (Top 10
predictors shown), correct predictor is
x
2
,
x
5
,
x
9
Rank
1 input
2 inputs
3 inputs
4 inputs
Predictor
MSE
Predictor
MSE
Predictor
MSE
Predictor
MSE
1
x
2
0.2993
x
2
,
x
5
0.0591
x
2
,
x
5
,
x
9
0.0064
x
2
,
x
5
,
x
7
,
x
9
0.0058
2
x
7
0.3034
x
2
,
x
9
0.1210
x
2
,
x
5
,
x
6
0.0592
x
2
,
x
5
,
x
8
,
x
9
0.0060
3
x
1
0.3600
x
2
,
x
7
0.1552
x
2
,
x
5
,
x
8
0.0694
x
2
,
x
5
,
x
6
,
x
9
0.0060
4
x
5
0.3627
x
1
,
x
2
0.1784
x
2
,
x
5
,
x
7
0.0698
x
1
,
x
2
,
x
5
,
x
9
0.0061
5
x
4
0.3699
x
5
,
x
7
0.1797
x
1
,
x
2
,
x
5
0.0851
x
2
,
x
4
,
x
5
,
x
9
0.0261
6
x
9
0.4052
x
7
,
x
9
0.1840
x
2
,
x
4
,
x
5
0.0857
x
1
,
x
2
,
x
5
,
x
7
0.0291
7
x
8
0.4236
x
5
,
x
6
0.1938
x
1
,
x
2
,
x
7
0.0871
x
2
,
x
4
,
x
5
,
x
7
0.0555
8
x
6
0.4286
x
4
,
x
7
0.1938
x
5
,
x
7
,
x
9
0.0983
x
2
,
x
4
,
x
5
,
x
8
0.0572
9
x
5
,
x
8
0.1985
x
1
,
x
2
,
x
6
0.1138
x
2
,
x
4
,
x
5
,
x
6
0.0580
10
x
4
,
x
5
0.2099
x
2
,
x
4
,
x
9
0.1211
x
1
,
x
2
,
x
5
,
x
8
0.0588