Biology Reference
In-Depth Information
Table 5.2
PCR primers and DNA probes for
Vibrio vulnifi cus
Primer
Sequence (5' —> 3')
Size of amplifi ed
Gene
Reference
or probe
sequence (bp's)
VVp1
CCG-GCG-GTA-CAG-GTT-GGC-C
519
cth
Hill et al
.
(1991)
VVp2
CGC-CAC-CCA-CTT-TCG-GGC-C
” ” ” ”
RAPD-Gen 1-50-03 AGG-A(C/T)A-CGT-G
-
-
Radu et al
.
(1998)
RAPD-Gen 1-50-09 AGA-AGC-GAT-G
-
-
” ” ” ”
RAPD-PSE420
TAT-CAG-GCT-GAA-AAT-CTT
-
-
Vickery et al. (1998)
M13
GAA-ACA-GCT-ATG-ACC-ATG
- -
Arias et al
.
(1998)
T3
ATT-AAC-CCT-CAC-TAA-AGG
- -
” ” ” ”
1038 probe
UAG-CGA-AAU-UCC-UUG-UCG
- -
” ” ” ”
L-vvh
TTC-CAA-CTT-CAA-ACC-GAA-CTA-TGA
205
vvh
Panicker et al. (2004)
R-vvh
ATT-CCA-GTC-GAT-GCG-AAT-ACG-TTG
” ” ” ”
VVAP probe
GAG-CTG-TCA-CGG-CAG-TTG-GAA-CCA
-
vvha
Wright et al
.
(1993)
RAPD
GGA-TCT-GAA-C
-
-
Warner and Oliver (1998)
D1
CCA-TCT-GTC-CCT-TTT-CCT-GC
373
tdh
Tada et al. (1992)
D2
CCA-AAT-ACA-TTT-TAC-TTG-G
” ” ” ”
D5
GGT-ACT-AAA-TGG-CTG-ACA-TC
199
tdh
” ” ” ”
D2
CCA-AAT-ACA-TTT-TAC-TTG-G
” ” ” ”
D5
GGT-ACT-AAA-TGG-CTG-ACA-TC
251
tdh
” ” ” ”
D3
CCA-CTA-CCA-CTC-TCA-TAT-GC
” ” ” ”
R3
GCC-TCA-AAA-TGG-TTA-AGC-GC
210
trh1
” ” ” ”
R5
TGG-CGT-TTC-ATC-CAA-ATA-CG
” ” ” ”
