Biomedical Engineering Reference
In-Depth Information
50. (a) S. W. Millward, T. T. Takahashi, R. W. Roberts,
J. Am. Chem. Soc
.
2005
,
127
, 14142-
14143; (b) A. Frankel, S. Li, S. R. Starck, R. W. Roberts,
Curr. Opin. Struct. Biol.
2003
,
13
, 506-512; (c) R. W. Roberts, J. W. Szostak,
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.
1997
,
94
,
12297-12302.
51. Y. Yamagishi, I. Shoji, S. Miyagawa, T. Kawakami, T. Katoh, Y. Goto, H. Suga,
Chem.
Biol
.
2011
,
18
, 1562-1570.
52. C. Heinis, T. Rutherford, S. Freund, G. Winter,
Nat. Chem. Biol
.
2009
,
5
, 502-507.
53. (a) J. D. Tyndall, D. P. Fairlie,
J. Mol. Recognit
.
1999
,
12
, 363-370; (b) D. P. Fairlie,
J. D. Tyndall, R. C. Reid, A. K. Wong, G. Abbenante, M. J. Scanlon, D. R. March, D. A.
Bergman, C. L. Chai, B. A. Burkett,
J. Med. Chem.
2000
,
43
, 1271-1281; (c) J. D. Tyndall,
D. P. Fairlie,
Curr. Med. Chem.
2001
,
8
, 893-907; (d) J. D. Tyndall, T. Nall, D. P. Fairlie,
Chem. Rev.
2005
,
105
, 973-999; (e) P. K. Madala, J. D. Tyndall, T. Nall, D. P. Fairlie,
Chem. Rev.
2010
,
110
, PR1-PR31.
54. R. C. Reid, L. K. Pattenden, J. D. Tyndall, J. L. Martin, T. Walsh, D. P. Fairlie,
J. Med.
Chem
.
2004
,
47
, 1641-1651.
55. (a) M. P. Glenn, L. K. Pattenden, R. C. Reid, D. P. Tyssen, J. D. Tyndall, C. J. Birch, D. P.
Fairlie,
J. Med. Chem
.
2002
,
45
, 371-381; (b) R. C. Reid, M. J. Kelso, M. J. Scanlon,
D. P. Fairlie,
J. Am. Chem. Soc.
2002
,
124
, 5673-5683; (c) J. D. Tyndall, R. C. Reid,
D. P. Tyssen, D. K. Jardine, B. Todd, M. Passmore, D. R. March, L. K. Pattenden, D. A.
Bergman, D. Alewood, S. H. Hu, P. F. Alewood, C. J. Birch, J. L. Martin, D. P. Fairlie,
J.
Med. Chem.
2000
,
43
, 3495-3504.
56. C. Park, K. Burgess,
J. Comb. Chem
.
2001
,
3
, 257-266.
57. Y. Feng, M. Pattarawarapan, Z. Wang, K. Burgess,
Org. Lett
.
1999
,
1
, 121-124.
58. E. Nnanabu, K. Burgess,
Org. Lett
.
2006
,
8
, 1259-1262.
59. (a) S. Maliartchouk, Y. Feng, L. Ivanisevic, T. Debeir, A. C. Cuello, K. Burgess, H. U.
Saragovi,
Mol. Pharmacol. 2000
,
57
, 385-391; (b) M. Pattarawarapan, M. C. Zaccaro,
U. H. Saragovi, K. Burgess,
J. Med. Chem.
2002
,
45
, 4387-4390; (c) M. C. Zaccaro, H. B.
Lee, M. Pattarawarapan, Z. Xia, A. Caron, P. J. L'Heureux, Y. Bengio, K. Burgess, H. U.
Saragovi,
Chem. Biol.
2005
,
12
, 1015-1028.
60. (a) E. A. Jefferson, S. Arakawa, L. B. Blyn, A. Miyaji, S. A. Osgood, R. Ranken, L. M.
Risen, E. E. Swayze,
J. Med. Chem
.
2002
,
45
, 3430-3439; (b) E. E. Swayze, E. A.
Jefferson, K. A. Sannes-Lowery, L. B. Blyn, L. M. Risen, S. Arakawa, S. A. Osgood, S. A.
Hofstadler, R. H. Griffey,
J. Med. Chem.
2002
,
45
, 3816-3819.
61. (a) F. Freire, S. H. Gellman,
J. Am. Chem. Soc
.
2009
,
131
, 7970-7972; (b) R. J. Woods,
J. O. Brower, E. Castellanos, M. Hashemzadeh, O. Khakshoor, W. A. Russu, J. S. Nowick,
J. Am. Chem. Soc.
2007
,
129
, 2548-2558; (c) D. Obrecht, E. K. Chevalier, J. A. Robinson,
Drug Discov. Today Technol.
2012
,
9
, e63-e69; (d) This forms the technological basis
of Aileron Therapeutics (www.aileronrx.com); (e) A. L. Jochim, P. S. Arora,
ACS Chem
Biol.
2010
,
5
, 919-923; (f) H.K. Cui, B. Zhao, Y. Li, Y. Guo, H. Hu, L. Liu, Y.G. Chen,
Cell Res.
2013
,
23
, 581-584; (g) Y.W. Kim, T.N. Grossmann, G.L. Verdine,
Nat. Protoc.
2011
,
6
, 761-771; (h) T.L. Joseph, D.P. Lane, C.S. Verma,
PLoS One
,
2012
,
7
, e43985.
62. This forms the basis of the PEMFinder and MacroFinder platforms of Polyphor:
http://www.polyphor.com.
63. (a) A. Davidson, T. C. Leeper, Z. Athanassiou, K. Patora-Komisarska, J. Karn, J. A.
Robinson, G. Varani,
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A
.
2009
,
106
, 11931-11936; (b) A.
Descours, K. Moehle, A. Renard, J. A. Robinson,
ChemBioChem
2002
,
3
, 318-323; (c)
N. Srinivas, P. Jetter, B. J. Ueberbacher, M. Werneburg, K. Zerbe, J. Steinmann, B. Van
der Meijden, F. Bernardini, A. Lederer, R. L. Dias, P. E. Misson, H. Henze, J. Zumbrunn,
