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Molecular Biology of Lignification in Grasses
MICHAEL J. HARRINGTON,
*
MAREK MUTWIL,
{
YVES BARRI
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RE
{
AND RICHARD SIBOUT
*,1
*INRA, UMR 1318 AgroParis Tech, Institut Jean Pierre Bourgin,
RD10, Versailles cedex, France
{
Max-Planck-Institute for Molecular Plant Physiology,
Potsdam, Germany
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Lusignan, France
I. Introduction . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
78
II. Spatio-Temporal Deposition of Lignins in Grasses. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
80
A. Initiation of Lignification may Vary Between Grasses and Dicots . . . .
81
B. Lignin Composition Varies According to Cell Types . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
82
III. Lignin Biosynthesis and Genetically Engineered Plants . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
84
A. 4-Coumarate: Coenzyme A Ligase (4CL) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
88
B. Cinnamoyl-C
O
A Reductase (CCR) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
88
C. Caffeic Acid O-Methyltransferase (COMT or OMT1) . . . . . . . . . . . . . . . . . .
89
D. Cinnamyl Alcohol Dehydrogenase (CAD) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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IV. Brown-Midrib Mutants with Unknown Loci. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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V. QTL and Breeding . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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VI. Network and Co-expression Data of Lignin Genes. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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A. A Case of Study: PAL Co-expression Network in Brachypodium . . . .
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B. Cross-species Co-expression Analysis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
98
1
Corresponding author: E-mail: Richard.sibout@versailles.inra.fr