Biology Reference
In-Depth Information
Table 9.7
Learned HMM parameters used in the
CpG Discover
System [
27
]. See the text for details.
Transitions
Emissions
Initial
A
+
C
+
T
+
G
+
A
−
C
−
T
−
G
−
A
C
T
G
A
+
0.2233
0.202
0.1745
0.3106
0.0229
0.0377
0.0196
0.0164
0.8358
0.0607
0.0501
0.0564
0.0742
C
+
0.2667
0.2511
0.3138
0.0746
0.023
0.0465
0.0226
0.0087
0.0382
0.9006
0.0266
0.0376
0.1005
T
+
0.093
0.252
0.245
0.3459
0.0093
0.0184
0.0251
0.0182
0.0624
0.0486
0.8376
0.0544
0.0309
G
+
0.1846
0.2703
0.1815
0.2326
0.0399
0.0272
0.0178
0.0531
0.0344
0.0451
0.0331
0.8904
0.1181
A
−
0.0323
0.0154
0.0154
0.0342
0.2684
0.1679
0.1496
0.3238
0.8699
0.0434
0.0452
0.0445
0.077
C
−
0.0243
0.0392
0.0146
0.0089
0.3052
0.2486
0.3013
0.065
0.0499
0.8827
0.0283
0.0422
0.2492
T
−
0.021
0.0274
0.0209
0.0372
0.0966
0.2415
0.2114
0.3511
0.0729
0.0389
0.8552
0.036
0.0692
G
−
0.048
0.0303
0.0187
0.0287
0.2575
0.207
0.1737
0.2432
0.0382
0.0307
0.0406
0.8935
0.2877
Search WWH ::
Custom Search